Se con il passaggio tra Windows Mobile 2003 (SE) e Windows Mobile 5.0, le differenze erano parecchie e decisamente evidenti, un po' meno lo sono quelle tra WM 5.0 e WM 6.
Sebbene molte delle differenze riguardino quello che per noi dev è importante (API esposte, tools, SDK etc. - vedi articolo Windows Mobile 6: Overview per sviluppatori), ce ne sono altre meno visibili ma altrettanto importanti, specie per quella fascia di utilizzatori che usa il device per motivi di lavoro.
Una tabella comparativa abbastanza dettagliata con le differenze "utili all'utente finale" è disponibile qui (file pdf). Personalmente la ritengo utile sia per noi dev, sia (e soprtattutto) se vogliamo convincere il responsabile di una azienda a fare il passaggio 
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